Lo voy a poner en mi página https://docs.moodle.org/39/en/Upgrading_FAQ#How_do_I_upgrade_from_1.9.x_to_3.9.3F porque si es muy frecuente la pregunta:
How do I upgrade from 1.9.x to 3.9?
1.x -> 1.9.19+ -> 2.2.11 -> 2.7.20 -> 3.2.9 -> 3.9
(It is better to upgrade to latest current stable before going to next branch, the same for plugins; upgrading from early stable branches usually works but there is no guarantee.)
Moodle 2.2.11 may be downloaded from https://download.moodle.org/stable22/.
Pero aplica para cualquier LTS por ejemplo yo lo hice a 3.5 y solo es cambiar la versión en el vínculo.
https://docs.moodle.org/35/en/Upgrading_FAQ#How_do_I_upgrade_from_1.9.x_to_3.5.3F
How do I upgrade from 1.9.x to 3.5?
1.x -> 1.9.19+ -> 2.2.11 -> 2.7.20 -> 3.0.10 -> 3.5
(It is better to upgrade to latest current stable before going to next branch, the same for plugins; upgrading from early stable branches usually works but there is no guarantee.)
Moodle 2.2.11 may be downloaded from https://download.moodle.org/stable22/
Si quieren ser muy meticulosos pueden ir a la versión que quieran https://docs.moodle.org/dev/Releases
O pueden ir a https://docs.moodle.org/en/Installation que los redigiira siempre al actual (yo prefiero los de Soporte de Largo Término LTS) y ahí buscar el upgrading faq.